Родился в Гунценхаузене, в 1601 изучал астрономию у Т. Браге в Праге, затем медицину в Падуе. Служил астрономом и математиком при дворе маркграфа в Ансбахе.
Одним из первых начал изучать небо с помощью телескопа. Составил первые таблицы среднего движения четырех известных в то время спутников Юпитера; первым обратил внимание на изменения их яркости; дал им названия, сохранившиеся до настоящего времени: Ио, Европа, Ганимед, Каллисто. Марию также принадлежит первое упоминание о туманности в созвездии Андромеды (спиральная галактика M31).
В его честь назван кратер на Луне.