Родился 25 февраля 1923 года в посёлке Тирлян Белорецкого района Башкирии в семье рабочего. Русский.
Окончил 8 классов, Белорецкий аэроклуб, Свердловскую авиационную школу пилотов в 1942
В Красной Армии с апреля 1941 года, призван Белорецким райвоенкоматом Башкирской АССР. В 1942 году окончил Свердловскую военную авиационную школу пилотов. В боях Великой Отечественной войны с 26 января 1943 года. Член ВКП(б)/КПСС с 1944 года.
Старший летчик штурмового авиаполка лейтенант Губин Е. И. за период с 26 января 1943 года по февраль 1944 года произвёл 82 боевых вылета, уничтожил 54 автомашины, 5 танков, 4 орудия полевой артиллерии, 29 зенитных точек, 1 склад с боеприпасами, 18 повозок, 5 пулемётных точек, 2 самолёта и до 350 солдат и офицеров противника.
После войны отважный лётчик-штурмовик продолжал службу в ВВС СССР. В 1948 году он окончил Тамбовские высшие авиационные курсы слепой и ночной подготовки лётчиков, а в 1955 году — Центральные лётно-тактические курсы усовершенствования офицерского состава.
С 1958 года подполковник Губин Е. И. — в запасе. Жил и работал в городе Куйбышеве (ныне Самара) инженером по оборудованию треста «Волгоэнергомонтаж».
Умер 5 марта 1991 года.
Почётный гражданин города Белорецк
Из наградного листа на Е.И. Губина: